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CRISPR/Cas12b系统实验

简要描述:CRISPR/Cas12b系统实验:CRISPR/Cas12b(原称 C2c1)属于 Class 2 Type V-B 型 CRISPR 系统,是继 Cas9 和 Cas12a 后的重要基因编辑工具。

  • 更新时间:2025-07-09
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详细介绍

一、分子机制与结构特性

(一)系统定义与分类

CRISPR/Cas12b(原称 C2c1)属于 Class 2 Type V-B 型 CRISPR 系统,是继 Cas9 和 Cas12a 后的重要基因编辑工具。其核心特征包括:

  1. 双 RNA 引导机制

    • 需 crRNA 与 tracrRNA(可融合为 sgRNA)共同引导靶向切割,兼具 Cas9 与 Cas12a 的部分特性 。

  2. 切割模式

    • 单一 RuvC 结构域 切割双链 DNA,形成 5-6 nt 的黏性末端(5' 突出),利于同源重组修复(HDR)。

  3. PAM 识别

    • 依赖 T-rich PAM 序列(如 5'-TTN-3'),扩展了 AT 富集基因组的编辑能力 。

(二)结构优势

特性Cas12b对比 Cas9/Cas12a
蛋白大小约 1,100 氨基酸(最小)比 Cas9(1,600 aa)和 Cas12a(1,300 aa)更小 
RNA 需求需 crRNA + tracrRNA(可融合为 sgRNA)比 Cas12a(仅需 crRNA)复杂,但比 Cas9 简化 
热稳定性温度敏感型(40–55℃激活)需工程化改造以适配哺乳动物细胞 

二、技术优势与性能

(一)核心优势

  1. 低脱靶率

    • GUIDE-seq 检测显示脱靶率 显著低于 Cas9(错误插入/缺失减少 >50%)。

  2. 高特异性

    • crRNA 引导序列更长(>42 nt),靶向精度更高 。

  3. 编辑模式

    • 诱导 纯插入突变率低,更倾向于产生小片段缺失,减少功能不可预测性 。

  4. 病毒载体适配性

    • 小分子量更易包装进 AAV 或慢病毒载体,提升体内递送效率 。

(二)与同类系统对比

参数Cas12bCas9Cas12a
PAM 序列5'-TTN-3'(T 富集)5'-NGG-3'(G 富集)5'-TTTV-3'(T 富集)
切割末端黏性末端(5' 突出)平末端黏性末端(5' 突出)
反式切割活性❌ 无❌ 无✅ 有(可切割 ssDNA)
多基因编辑需多 sgRNA需多 sgRNA✅ 支持 crRNA 阵列

:Cas12b 切割模式使其在 基因治疗 中避免产生新表位,降低免疫风险 。


三、应用场景与前沿案例

(一)生物医学应用

  1. 抗病毒治疗

    • HIV :在 T 细胞中单次编辑即可清除全部传染性 HIV,效率优于 Cas9 。

  2. 遗传病修复

    • 联合 HDR 通路实现 β-地中海贫血基因精准修复,血红蛋白恢复至正常水平 。

  3. 肿瘤免疫

    • 编辑 PD-1/CTLA-4 双靶点,降低 CAR-T 细胞耗竭 。


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